База данных генотипированных образцов ДНК мясных и молочных пород Казахстана

Для достижения оптимального генетического прогресса в животноводстве, оценка родословной является неотъемлемой частью в последующем разведении. Недостоверное происхождение может привести к неправильному разведению, что несет в себе большие экономические потери. При этом, подтверждение достоверности происхождения молодняка от быка-производителя связано с оценкой быка-производителя по качеству потомства и позволяет прогнозировать будущую продуктивность потомства.

Основным известным методом происхождения племенных животных является анализ последовательностей ДНК, который широко используется в странах с высокоразвитым скотоводством. При анализе последовательностей ДНК широко распространенно генотипирование по аллелям микросателлитных STR-локусов и генотипирование по SNP-маркерам. Эти требования широко описаны в рекомендациях Международного общества генетики животных (ISAG) и Международного комитета регистрации животных (ICAR).

Фото: plemnic.kz
Фото: plemnic.kz

Научные исследования доказали, что, используя данные генотипирования образцов ДНК молодых животных и информацию об их геноме, можно определить происхождение теленка с 95% статистической значимостью при вероятностном пороге родства 0,9997%. Это намного лучше, чем использование записей о родителях в производственных журналах, при которых достоверность информации не превышает 30-40%.

На сегодняшний день специалистами ТОО «Научно-инновационный центр животноводства и ветеринарии» была создана казахстанская база данных генотипированных образцов ДНК мясных и молочных пород (грант МОН РК №2745/ГФ-3 2013-2015 гг.) и получено авторское свидетельство № 1438 от 29.07.2014 г.

Авторское свидетельство на базу данных
Нажмите на картинку, чтобы увеличить её.

База данных построена на основе современных технологий: Microsoft.NET Framework 4.0, IIS 7.5, Microsoft SQL Server 2008 R2. Интерфейс базы функционирует в режиме on-line (через сеть Интернет), и доступ к данной базе открыт для отечественных генетических лабораторий и республиканских породных палат крупного рогатого скота.

База ДНК имеет тесную интеграцию с базой данных ИАС, что позволяет использовать результаты работы при ведении селекционной и племенной работы для подтверждения отцовства племенных животных. В базу могут быть внесены результаты генотипирования ДНК по 21 микросателлитным STR-локусам (Short Tandem Repeat), в том числе 12 микросателлитов, рекомендованные ISAG. Также, база данных рассчитана на внесение результатов генотипирования образцов ДНК по не менее 245 SNP-маркерам (Single nucleotide polymorphism), в том числе 100 SNP-маркеров рекомендованных ISAG. Эти научные исследования были проведены в рамках грантового проекта Министерства образования и науки РК №1891/ГФ-4 (2015-2017 гг.).

Фото: plemnic.kz
Фото: plemnic.kz

Вместе с тем, в базе данных ДНК производится расчет достоверности происхождения скота, т.е. фактически устанавливается отцовство племенных животных, а также в автоматическом режиме формируется генетический сертификат, с указанием сведений о животном и результатами генотипирования ДНК.

Фото: plemnic.kz
Фото: plemnic.kz

Авторы выражают признательность специалистам и научным сотрудникам зарубежных лабораторий Университета Queensland (Австралия) и GeneSeek NeoGen Inc.(США), а также отечественных лабораторий ТОО «GENESIS.KZ», ТОО «Қазақ Түлпары» и ТОО «Казахстанско-Японский инновационный центр» за проведенную работу и содействие в реализации целей проекта ТОО «Научно-инновационный центр животноводства и ветеринарии».С использованием отечественной базы данных ДНК выданы генетические сертификаты с подтвержденным происхождением 1318 бычков (STR-локусы) и 1149 бычков (SNP-маркеры).

Авторы: Тлеуленов Ж.М., Аюпова А.Б., Жамалиева С.А.
ТОО «Научно-инновационный центр животноводства и ветеринарии»
e-mail: nic-zhiv@plemnic.kz

Поделиться материалом

Читать ещё

  • Опрос

    Что чаще всего воруют рабочие вашего сельхозпредприятия?

    Показать результаты

    Загрузка ... Загрузка ...
  • Архивы